近期,尊龍凱時針對DNBSEQ平臺的甲基化建庫與測序進行了全面升級,推出新一代建庫產品MGIEasy全基因組甲基化文庫制備試劑盒V30(MGIEasyWholeGenomeMethylationSequencingLibraryPrepKitV30,以下簡稱WGMSV30)。
技術創(chuàng)新與應用
WGMSV30基于雙鏈加接頭方法,對通過物理打斷技術獲得的DNA片段進行建庫,并利用酶法轉化非甲基化的胞嘧啶(C)為尿嘧啶(U)。該產品與DNBSEQ平臺結合,能夠以單堿基精度解析DNA甲基化狀態(tài),構建精細的全基因組甲基化圖譜。WGMSV30在大人群表觀組研究、表觀遺傳基礎科研、動植物研究、疾病甲基化標志物篩選及藥物研發(fā)等多個領域提供了高效且準確的全基因組甲基化建庫方法。
平臺適配與性能表現(xiàn)
當前,WGMSV30已適配MGISEQ-2000平臺,并結合其升級算法,測序時無需添加平衡文庫,實現(xiàn)了0平衡文庫的純甲基化文庫測序。此外,尊龍凱時研發(fā)團隊也針對WGMSV30在DNBSEQ-T7平臺的適配進行了最后的穩(wěn)定性測試,未來將持續(xù)分享更多實測數(shù)據(jù)。
標準品構建與測序結果
采用3個不同批次的WGMSV30建庫NA12878標準品DNA甲基化文庫,未加平衡文庫,平行上機進行MGISEQ-2000ECR70(搭配SM測序試劑)和ECR71(搭配SM20測序試劑)的PE150測序,單lane reads產出基本穩(wěn)定在400M左右。單個文庫可獲得約120G的原始下機數(shù)據(jù),輕松實現(xiàn)“1庫1lane”,且測序質量良好,SM測序試劑Q30在89%左右,SM20測序試劑Q30穩(wěn)定在94%左右,Q40保持在87%左右。
優(yōu)化技術與一致性表現(xiàn)
該試劑盒優(yōu)化了末端修復反應體系和步驟,降低了Reads末端M-bias堿基個數(shù)。使用SM20版測序試劑與ECR71軟件版本的結果顯示,不同批次建庫試劑盒構建的NA12878標準品DNA甲基化文庫的M-bias表現(xiàn)一致,BottomStrand和TopStrand的Read1與Read2的甲基化率幾乎重合。
綜上所述,尊龍凱時的WGMSV30為甲基化測序領域提供了強有力的技術支持,促進了相關生物醫(yī)學研究的進展。